为完善金鳌洲塔保护体系，健全管理体制，扎实推进金鳌洲塔保护管理工作，2012年，东莞市博物馆委托同济大学建筑设计研究院依照《文物保护法》开展《广东省文物保护单位金鳌洲塔保护规划（2012——2025）》的编制工作，2017年12月1日，经省人民政府批准后，东莞市人民政府于2018年2月14日颁布实施。

    自2012年启动编制金鳌洲塔保护规划以来，作为该塔的保护管理机构，东莞市博物馆认真履行职能，严格遵循保护规划思路，相继完成了金鳌洲塔展厅及管理用房落架大修、《古塔韵 水乡情》展览设计制作、编制了《金鳌洲塔修缮勘察设计方案》，按审批通过的方案实施了金鳌洲塔维修，并顺利通过了省专家验收。